Wie im folgenden Artikel zu erfahren ist, gibt es Meerschweinchen vermutlich bereits seit 40 – 35 Millionen Jahren. Somit ist das Meerschweinchen wohl eines der ersten Haustiere der Welt, was die Erforschung und die wissenschaftliche Gültigkeit seiner genauen Abstammungsgeschichte so schwierig macht.
Besonders die Einteilung in die biologische Systematik, die ohnehin nur bei wenigen Tierarten vollends erforscht ist bzw. nicht oder nur unzureichend mit Ergebnissen anderer Wissenschaften korrespondiert, ist nicht als der Weisheit letzter Schluss zu betrachten; vielmehr variiert sie immer - je nach Akzeptanz neuester wissenschaftlicher Erkenntnisse - und bietet somit stets Raum für andere Zuordnungsvarianten.
Einigkeit herrscht aber über die Zuordnung der Meerschweinchen zu den Nagetieren (Rodentia). So besitzen fast alle von ihnen sowohl im Ober- wie auch im Unterkiefer je zwei Nagezähne, die deutlich größer als die übrigen Zähne sind und zudem permanent wachsen, was bedeutet, dass sie durch regelmäßiges Nagen abgenutzt werden müssen, ähnlich einem Fingernagel, der immer wieder gefeilt bzw. geschnitten wird. Zudem sind die meisten der Rodentia eher klein und sie bewegen sich auf vier relativ kurzen Beinen vorwärts.
